第一部《动物大机密》讲述了这样的故事:地球上有两个生命体,一是哺乳类动物,二是鱼类。他们分别叫“大卫”和“伊莎贝尔”,其中大卫在天空飞翔,而伊莎贝尔则住在水里。但是某一天,人类打破了平衡,来到海边建起工厂,并且不断地向海洋排放污染物质。从此以后,两种动物的世界就开始发生改变。
第二部《动物大进击》讲述了一群可爱的小动物,为保护家园、抵抗敌人展开了激烈的斗争。它们勇敢善良,团结友爱,与自然灾害做顽强的斗争,最终取得胜利。本片通过对各种动物形象的塑造,传达出正义必将战胜邪恶的信念。